마이크로새털라이트 마커를 이용한 땅콩 유전자지도 작성 > 자료실

브라질 ‘de Braslia' 대학과 ’Catlica de Brasilia'대학 세포생물공학부의 공동연구팀은 유전자 기본의 마이크로새털라이트(microsattelite) 마커를 이용하여 땅콩(Arachis hypogaea)에서 유전자지도를 작성한 결과를 ‘TAG'지 최신호에 발표했다.

땅콩 재배종은 열대, 아열대 지역에서 널리 재배되는 세계적으로 중요한 작물 중의 한가지인데, 야생종 땅콩은 저항성을 지니는 여러 병원성, 비병원성 스트레스에 대해 재배종 땅콩은 매우 감수성을 보이는 것으로 알려져 있다.

야생종의 우수한 저항성 유전자들을 재배종으로 도입하기위한 첫 번째 육종 사업으로 본 연구팀은 SSR 마커를 이용한 유전자 지도를 작성하게 되었다. 지도 작성을 위한 식물 집단으로는 두 가지 야생종인 ‘A. duranensis’ 와 ‘A. stenosperma’를 교배하여 육성된 F2 집단을 사용했고, 마커는 GenBank에 등록된 염기서열들을 이용하거나 게노믹 라이브러리로부터 유래한 SSR, 그리고 EST 데이터베이스를 기초로 하여 개발된 271개의 새로운 SSR 마커들을 활용하였다.

이들 중 재배종 땅콩에서 66개의 마커들이 다형성을 보였고, 271개의 새로운 마커들과 기존에 보고된 바 있던 162개의 마커들을 후대에서 탐색해본 결과 47.1%에 해당하는 204개의 마커들이 다형성을 보였는데, 이들 중 170개는 공우성 마커(codominant)이고 34개는 우성(dominant) 마커였다. 후대 검정시 1:2:1의 분리비로 분리되는 80개의 공우성 마커들을 우선적으로 사용하여 지도를 작성하고, 그 후에 우성 마커들을 올렸다.

완성된 유전자 지도는 전체 지도 길이가 1,230.89cM 이었고, 11개의 연관군으로 구성되었으며, 마커 간 평균 거리는 7.24cM 인 것으로 확인되었다. 이 유전자 지도는 SSR 마커로 구성된 최초의 Arachis 유전자 지도이면서 모든 마커들이 현재 공개되어 사용 가능한 마커들이라는 데 의의가 있다. 또한 대부분의 마커들이 ESTs로부터 유래된 마커들로서 유전자 기본의 마커들이라는 점도 중요하다.

그리고, 연관군 순서도 다른 집단의 유전자 지도에서도 입증이 되어 Arachis의 다른 참조 유전자 지도로의 이동이 가능하다고 연구팀은 설명한다.