콩에서의 마이크로새털라이트 마커의 유용성 > 자료실

프랑스 ‘INRA' 연구센터와 미농무성 산하 연구기관들의 공동 연구팀은 콩(Pisum sativum L.)에서 마이크로새털라이트(Microsatellite) 마커의 다형성을 이용한 유전자 지도 작성의 수행 결과를 ’TAG'지 10월호에 발표했다.

콩의 유전학적 연구를 위한 분자 마커들의 적용범위를 확장하기위해 새로운 SSR 마커를 개발하여 유전자 지도 상에 위치시키고, 효과적인 유전자형 분석을 좀 더 신뢰도가 높으면서 저렴하게 수행하는 방법을 제공하고자 본 연구를 수행하게 되었다.

8가지의 유전자형에 대한 340개 SSR 마커를 조사하여 최적의 DNA 증폭 조건을 확립했고, 이들 중 309개 마커들에 대한 다형성 수준을 결정했다. 이 데이터는 다른 종에서의 결과들과 비교해보았을 때, 다형성 유전자좌 한 개 당 평균 3.8 대립형질 수를 보이고, PIC 값은 0.62로서 매우 높은 수위임이 확인되었다. 

본 연구의 주 목적인 콩 유전자 지도를 최대한 많은 수의 SSR 마커로 포화시키기 위하여 연구팀은 세 가지 교배 집단을 재료로하여 239 SSR 마커로 구성되는 1,430cM의 유전자 지도를 완성하였다. 이 지도는 게노믹 라이브러리로부터 유래한 익명의 SSR 마커 216개와 유전자 기초의 13개 SSR 마커로 구성된다.

이들 마커는 7개의 연관군 전체에 비교적 고르게 분포되어 있는 편이며, 마커 간 평균 거리가 85% 이상이 약 10cM 이하의 간격을 보인다. 또한, 세 가지 다른 집단에서의 연관군 수와 마커들의 순서가 거의 동일한 것으로 확인되었다.

연구팀은 “본 보고가 이들 SSR 마커들을 활용함으로서 콩의 유전학 연구나 QTL 유전자 지도 작성 등의 여러 연구가 효과적으로 수행되어질 것이다.”라고 기대한다.